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    有无澳门太阳城最新网站的研究人员开发了一种方法来隔离T细胞绑定到不同的目标,然后它们的RNA序列。

    图片:scist要么ies LLC

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识别技术的T细胞引发的对某些过敏或感染

有无澳门太阳城最新网站的研究人员开发了一种方法来隔离T细胞绑定到不同的目标,然后它们的RNA序列。

研究人员开发到分离物和序列的方法的T细胞的RNA发生反应的特定该目标。


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萨拉·麦克唐纳
电子邮件: s_mcd@mit.edu
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当你的免疫系统暴露于疫苗,过敏原,或感染微生物,T细胞亚群可以识别一个跃入行动的外国入侵者。一些T细胞都准备杀死被感染的细胞,而其他人作为存储单元中循环,在整个身体,保持手表的情况下,入侵者会再次出现。

有MIT的研究人员现在想出了一个办法来识别T细胞目标共享的业主,作为所谓的高通量单细胞RNA测序过程的一部分。分析的这种可以通过那些确定哪些基因在他们考虑的时间打开,露出T细胞的独特功能。在一项新研究中,研究人员使用的技术来鉴定产生在患者出现对花生过敏的炎症身份ESTA T细胞。

这是现在的工作正在进行中,该方法ESTA的研究人员正在使用,以研究如何患者的T细胞响应对花生过敏,这将有助于他们确定是否将治疗病人主人上班的口服免疫疗法。这些研究有助于指导的研究人员也开发和测试新的治疗方法。

“食物过敏影响关于人口的5%,而真正有没有一个明确的临床干预比其他避税,这会造成很大的压力对家庭和患者本人,说:”学家克里斯托弗·爱,雷蒙一个。和海伦即ST。化学工程教授洛朗和澳门太阳城最新网站的科赫研究所综合癌症研究中的一员。 “了解哪些驱动器的基本生物学仍然是这些反应的真正关键的问题。”

爱和Alexķ。 Shalek,谁是辉瑞公司劳巴克职业发展助理教授在澳门太阳城最新网站,化学副教授,医学工程和科学(IMES)澳门太阳城最新网站的核心成员,与科赫研究所的校外成员,都是资深作者这项研究在今天出现 自然免疫学。论文的主要作者是研究生昂安迪·托德您gierahn和前博士后。

提取信息

研究人员的新方法建立在以前的工作及其对细胞的大量人口进行单细胞RNA测序迅速发展的技术。通过测序信使RNA,科学家们可以发现它们在一个时间表达的基因报错,让他们见识到单个细胞的功能。

免疫细胞,如T细胞进行RNA测序,是极大的兴趣,因为T细胞在免疫反应,使许多不同的角色。然而,以往的研究测序无法识别T细胞的群体作出回应,以一种特殊的目标,或抗原,这是由T细胞受体(TCR)的顺序决定。因为这是单细胞测序RNA序列一般标记和各只有一个RNA分子的端部,并在MOST T细胞受体基因的变异的在分子,其不会被测序的相对端被发现。 

“长期以来,人们一直在描述性T细胞及其转录用这种方法,但没有信息关于什么样的T细胞受体卫生组织的细胞有,”你说。 “当这个项目开始,我们想,我们如何可以尝试恢复从库,信息的方式,这些这并不能掩盖这些数据集的单细胞分辨率,并且不要求我们的工作流程戏剧性地改变我们的测序和平台“。

在一个单一的T细胞,RNA编码的T细胞受体拼成小于单元的总RNA的1%,因此,MIT的研究小组想出了一个放大到方式的那些特定分子RNA再拉出来的总样本的使他们可以完全测序。每个RNA分子标记有条形码来揭示它来哪个单元从,于是投其所好,研究人员能够T细胞的目标与他们的RNA表达模式。 ESTA允许他们确定在靶​​特异性T细胞群即抗原哪些基因是激活的。

“为了把T细胞功能的来龙去脉,你要明白它是什么,他们正在试图认识,” Shalek说。 “这种方法让你把现有的单细胞RNA测序文库,并拉出您可能希望相关序列表征。其核心,该方法是提取一些认为是隐藏的全基因组表达谱数据内的信息一个简单的策略。“

ESTA的另一个优点是,技术是它不需要昂贵的化学物质,设备凭借许多实验室已经具备,而且可以应用到以前处理多个样本,研究人员说。

分析过敏

在里面 自然免疫学 论文中,研究人员证明,他们可以利用这种技术来挑选出是人乳头状瘤病毒有效对抗小鼠T细胞后的小鼠接种的已病毒。他们发现,即使全部反应后的病毒,这些T细胞,这些细胞有不同的电阻温度系数,似乎是在不同的发展阶段 - 有些人很杀死感染的细胞被激活,而其他致力于发展是和分裂。

研究人员随后分析了来自四个病人对花生过敏的采取的T细胞。使细胞暴露于过敏原花生后,他们能够确定对那些被致敏活性T细胞。他们还发现这是最活跃的,并发现了一些那名产生炎性细胞因子即是相关联过敏反应通常T细胞亚群。

“现在我们可以开始分层的数据揭示了什么是最重要的细胞,这是我们能够独自测序之前不认同RNA,”你说。

爱的实验室目前已与研究人员合作,在美国马萨诸塞州总医院使用这种技术来跟踪人接受口服免疫疗法对花生过敏的免疫反应 - 一个技术,涉及消费的过敏原少量,使免疫系统耐受建立它。

在临床试验中,这种技术,被证明在一些但不是所有病人的工作。澳门太阳城最新网站/ MGH团队希望将有助于他们的研究确定可用于预测哪些病人会回应最好的治疗因素。

“当然,一个想是否有一个更好的感觉的干预将是成功与否,趁早,”爱说。

也可以被用来帮助制定和监测免疫疗法治疗癌症,如CAR-T细胞治疗,其中涉及编程患者自身的T细胞靶向肿瘤ESTA策略。 Shalek的实验室ESTA还积极运用技术与合作者在MGH,澳门太阳城最新网站和哈佛大学的Ragon研究所鉴定在抵抗感染HIV和肺结核这样的参与T细胞。

该研究是由科赫研究所的支持资金(核心)由美国国立卫生研究院资助的科赫研究所达纳 - 法伯/哈佛癌症中心桥项目,该研究所广泛的澳门太阳城最新网站和哈佛大学,阿诺德和食物过敏科学倡议梅布尔贝克曼基金会的学者塞尔奖,化学斯隆研究奖学金,皮尤 - 斯图尔特学者奖励计划,以及美国国立卫生研究院。


主题: 研究, 免疫学, 化学工程, 化学, 科赫研究所, 学院为医学工程和科学器(IME), 科学学院, 工程学院, 医学, 卫生科学与技术, RNA, 美国国立卫生研究院(NIH)

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