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  • 原位测序识别在池CRISPR文库的每个小区中的基因敲除。荧光显微镜记录两者的细胞表型和测序数据(细胞核以灰色示出和核苷酸碱基是绿色=鸟嘌呤,红色=胸腺嘧啶,品红=腺嘌呤和青色=胞嘧啶)。有3553个细胞中的视场中。

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    图片:戴维·费尔德曼

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成像细胞的遗传筛选组合增强了基因组的发现

原位测序识别在池CRISPR文库的每个小区中的基因敲除。荧光显微镜记录两者的细胞表型和测序数据(细胞核以灰色示出和核苷酸碱基是绿色=鸟嘌呤,红色=胸腺嘧啶,品红=腺嘌呤和青色=胞嘧啶)。有3553个细胞中的视场中。

新的基于图像的基因筛查方法帮助研究人员确定炎症的关键调节。


下面的新闻稿是由澳门太阳城最新网站和哈佛大学的Broad研究所今天发布。

科学家经常使用的遗传筛选扰乱,或改变的活性,基因在哺乳动物细胞中,一次一个,学什么这些基因做。汇集屏幕采取同样的方法,但通常涉及横跨整个基因组有更多的遗传扰动。然而,与合并屏幕,科学家只能追踪细胞存活和其他简单的全细胞测量。

显微镜是一种重要的工具,它允许生物学家同时测量高分辨率许多细胞功能。研究人员试图遗传筛选与显微镜结合起来,研究了广泛的细胞行为的基因的影响,但在同一时间做这一个基因已被昂贵和费时。

现在,研究人员在澳门太阳城最新网站和哈佛大学和澳门太阳城最新网站的Broad研究所已经开发出结合了大规模汇集遗传筛选与细胞行为的基于图像分析的新方法。这种方法,称为光汇集屏幕,使研究人员能够研究基因如何影响与时间和空间分辨率复杂的细胞过程的方式,其他联合屏幕不能。

“这种新的方法,任何人都可以用显微镜来筛选几天数以千计的基因没有专门的设备说,”辛格avtar,在实验室中postdoct 保罗·布莱尼 在广阔。

这项研究成果发表在 细胞,由资深作者布莱尼,在生物工程澳门太阳城最新网站的部门广,副教授核心机构成员领导。辛格与戴维·费尔德曼,谁是以前在张枫和布莱尼的实验室物理学博士研究生一起共同第一作者。

作者通过在数百万个细胞成像的蛋白质称为P65的细胞定位研究的952个基因上的免疫调节复合物称为NF-κB的信号传导活性的作用。他们发现了两个基因的一个新的角色, med12med24在NFkB信号的松弛。

“希望通过在活细胞显微镜可以让你看到基因如何在空间和时间影响生物过程 - 这是你不能轻易被其他方法捕获,”费尔德曼说。


主题: reearch, 生物学, Broad研究所, 遗传学, 生物工程, 工程学院, 成像

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